НИУ осуществляет свою деятельность в рамках основных научных направлений филиала,организуя и реализуя научно-исследовательские,научно-методические,проектные,конструкторские,технологические работы в соответствии техническими заданиями договоров с заказчиками в рамках хоздоговорных тем.
Осуществляется научное,организационное,методическое и финансовое сопровождение научно-исследовательских и научно-методических договоров.
Востребована научно-методическая работа, направленная на разработку, апробацию и внедрение инновационных образовательных технологий и сопровождаемая, как правило, переподготовкой и/или повышением квалификации. Она осуществляется по заказам организаций системы образования городов Стерлитамака, Салавата, Ишимбая, Мелеуза, Кумертау, Уфы, а также Ишимбайского, Мелеузовского, Куюргазинского, Кугарчинского, Зианчуринского, Зилаирского, Хайбуллинского ,Федоровского, Стерлибашевского, Стерлитамакского, Миякинского, Альшеевского, Давлекановского, Гафурийского, Архангельского, Бурзянского и Аургазинского районов.